המכון מפעיל ספריה מחקרית גדולה, הוצאה לאור ותיקה, ומפעיל את המוזיאון למורשת עדות ישראל, מוזיאון יחיד מסוגו ובו תצוגות בחיי החומר והרוח של יהדות המזרח ואשכנז, אתיופיה והודו ועוד.
המוזיאון והמכון מפעילים פעילות חינוכית ענפה, לקבוצות ויחידים, כמו גם בהפקת אירועים מיוחדים וימי עיון רבים.